项目信息

项目名称：土壤宏病毒组测序

项目编号：XF-WSBX-******

公告开始日期：2025-09-18 16:55:12

公告截止日期：2025-09-25 18:00:00

******大学

付款方式：货到付款，甲方在到货验收后15日内向乙方一次性支付本项目的总额

联系人：中标后在我参与的项目中查看

联系电话：中标后在我参与的项目中查看

签约时间要求：成交后7个工作日内

到货时间要求：

预算：￥480000.00

收货地址：

供应商资质要求：符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

公告说明：

采购清单

采购商品：土壤宏病毒组测序

采购数量：192

计量单位：项

所属分类：其他服务

预算：￥2500.00

技术参数及配置要求：对土壤样本进行宏病毒组测序及分析。数据质量Q30＞80%，Q20＞85%，测序模式为PE150，总数据量不低于10G raw data。完成病毒序列的鉴定和分类注释、病毒丰度统计、基因预测、功能分析，多样性分析、统计分析、病毒宿主预测等，具有数据分析团队和服务器集群分析平台，拥有检测平台实验能力，拥有宏病毒组云平台分析，独立完成宏病毒组测序及数据分析工作，样本质检合格后，40个自然日完成宏病毒组学检测及分析工作。
★1、使用Qubit检测DNA和RNA的浓度，如果总量不满足建库，可以选择使用illustra Ready-To-Go GenomiPhi V3 DNA Amplification Kit ******试剂盒进行全基因组扩增或REPLI-g Cell WGA & WTA Kit（Qiagen 150054）试剂盒全转录组扩增。
★2、构建平台测序文库，文库浓度在1ng/uL以上，体积≥20ul，接头污染占比＜10%，主峰片段大小在300-600bp之间。
★3、进行PE150双端测序，每个检测样本的数据量不低于10G raw data，Q30>80%。
4、数据产出：每个样本测序产出有效数据量不低于10G raw data，碱基类型分布均匀且无分离现象，测序Q30＞80%。若数据质量不合格，投标方需免费补测或重测直至数据质量符合要求。
★5、具有数据分析团队和服务器集群分析平台，提供宏病毒组云分析流程，在线自主设置参数动态交互分析（提供云平台交互分析操作的相关截图）。
5.1、标准分析：
（1）下机数据的质控：使用软件 Fastp或 Trimmomatic对原始测序数据进行质控。
（2）拼接组装：通过专业拼接软件Megahit，拼接得到contig序列。
（3）病毒序列的鉴定和分类注释：DNA宏病毒组使用CheckV和Virsorter2软件进行病毒鉴定，RNA宏病毒组使用CheckV软件进行病毒鉴定，使用 PhaGCN2软件对序列进行病毒分类学注释。
（4）病毒丰度统计：将 reads 比对到鉴定后的病毒 contigs 上，计算每个 contig 的 RPKM 值，进行样品间相比较分析。
（5）基因预测：采用 Prokka对病毒 contigs 进行ORF预测。
（6）功能分析：利用预测出来的基因蛋白序列与 UniProtKB/Swiss-Prot/KEGG 数据库的病毒序列比对，获得功能注释信息。
（7）多样性分析：通过单样本的多样性（Alpha 多样性）分析反映环境病毒的丰度和多样性。通过 Beta 多样性分析来比较不同样品在物种组成方面存在的差异大小，根据距离矩阵获得样品聚类热图及样品 PCA、PCoA 图。
（8）统计分析：根据不同的分组数及重复数，选择不同的统计检验方法，分析各个分类层级上每个物种在组间的差异情况，寻找具有统计学差异的 Biomarkers。
（9）病毒宿主预测：鉴定得到的病毒序列，使用 CHERRY软件和 PHP软件分析预测宿主。
5.3、云平台要求：能够提供宏病毒组云分析流程，云平台可在线自主设置参数动态交互分析，分析呈图标准化，符合CNS期刊要求；能够提供400+款的小工具助力科研，包括噬菌体云工具：PhaMer——鉴定噬菌体， PhaTYP——预测噬菌体生活方式，PhaGCN——预测噬菌体分类，CHERRY——预测噬菌体宿主。
6、数据交付：
6.1、数据量：每个样本测序产出有效数据量不低于10G raw data，碱基类型分布均匀且无分离现象，测序Q30＞80%。
6.2、检测周期：如需投标方人员进行上门取样本，收到样本后5个自然日提供样本DNA质检报告，25个自然日完成建库测序，10个自然日完成云平台分析，个性化分析周期另行商议，且越快越好。
6.3、交付内容：包括但不限于质检合格的原始数据、完整的结题报告（交互式云平台+PDF静态报告，含质检报告，提取和测序建库批次以及日期等信息，DNA检测质量信息）、前处理流程及质控方法材料（中英文版参考资料）。采用移动硬盘进行数据或者网络传输，移动硬盘由采购方提供并且主要信息安全保密工作，如网络传输需增设密码。
6.4、数据存储：在项目结题完成全部数据交付后，投标方承诺数据保存时间不少于1年。
6.5、样本的保存及返回：应采购方需求提供样品保存和返还服务，保存和返还时限为自数据交付之日起5个月内。
7、（商务要求）售后服务要求：
7.1、投标方需定期进行项目进展汇报，使采购方及时掌握项目进度。在项目进展环节，提供实时且透明化的项目进展情况反馈服务。
7.2、投标方需提供24小时售后服务，采购方可通过官网、邮件、电话等其他方式与相应的技术人员沟通交流。
7.3、投标方应提供不少于一次的测序数据解读数据相关说明，积极配合招标方进行后期样本分析及样本回溯，提供售后服务支持。

售后服务：质保期:1年;